文久三年九月、女剣士の橘凛は自身を「宿敵」として執拗に付け狙ってくる日奉祭と共闘する羽目に陥る。新興財閥「長崎屋」の娘・明日香が二人に課した任務は「錦の御旗の捜索」。他の女剣士たちも錦の御旗を探す中、困難を極める旅が始まる。「幕末女剣士の事件簿」シリーズ第五作。